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真核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
轉(zhuǎn)錄組即特定組織或細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所有轉(zhuǎn)錄本的總和，包括 mRNA 和非編碼 RNA（即Non-coding RNA，如 tRNA，rRNAs，microRNAs，piRNAs 和 long ncRNAs 等）。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 (Transcriptome sequencing) 主要指通過(guò)高通量測(cè)序研究特定組織或細(xì)胞在某個(gè)時(shí)期轉(zhuǎn)錄出來(lái)的。mRNA，可以用來(lái)研究基因結(jié)構(gòu)和基因定量分析，并預(yù)測(cè)新轉(zhuǎn)錄本，是深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強(qiáng)大手段和工具。目前，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于動(dòng)植物發(fā)育階段的研究、優(yōu)良品種基因的篩選和疾病治療等。
技術(shù)路線
送樣建議
| 物種 |
濃度(Qubit) |
體積 |
總量 |
基因組完整性 |
| 真菌 total RNA |
≥20ng/μL |
15μL-100 μL |
≥2μg |
RIN≥6.5 28S/18S≥1.0;圖譜基線無(wú)上抬，5S?峰正常
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| 其他動(dòng)、植物total RNA |
≥20ng/μL |
15μL-100 μL |
≥2μg |
RIN≥6.5 28S/18S≥1.0;圖譜基線無(wú)上抬，5S?峰正常
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| 原核 total RNA |
≥20ng/μL |
15μL-100 μL |
≥2μg |
RIN≥6.5 28S/18S≥1.0;圖譜基線無(wú)上抬，5S?峰正常
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技術(shù)參數(shù)
| 有參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 |
測(cè)序策略 |
數(shù)據(jù)量 |
周期 |
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HiSeq4000 PE150 |
6G clean date |
45個(gè)自然日 |
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